Роберт Бойль родился 25 января 1627 года в ирландском поместье Ликсмор Касле в зажиточной многодетной семье, отец герцог Коркский обеспечил безбедное существование детям.
Первые годы жизни ребёнка были не слишком счастливыми, в три года Робер потерял мать, был хилым и болезненным.
По существовавшей тогда в аристократических семьях традиции, когда Роберту исполнилось 8 лет, его отдали в Итонский колледж, одно из престижных закрытых учебных заведений Англии, но отец через три года забрал его оттуда, чтобы направить для продолжения учебы в Европу, в Швейцарию.
В Женеве Роберт в течение двух лет изучал математику, философию и юриспруденцию, потом он предпринял длительное путешествие по Европе, в частности, по Италии, где он с увлечением знакомился с произведениями искусства.
К тому моменту отец скончался, оставив любимому наследнику состояние.
В Лондоне Роберт стал завсегдатаем приемов для местной интеллигенции, свел знакомство с учеными, политиками и литераторами, в Столбридже он организовал лабораторию, куда выписывал книги, Бойль также начал изучать философию и богословие.